求助：3D打印新型冠狀病毒模型

這幾天有熊友向南極熊建議，3D打印新型冠狀病毒模型，便于醫(yī)生和科學家更加直觀對其進行研究。

我們可以從“新型冠狀病毒國家科技資源服務(wù)系統(tǒng)”獲取到病毒相關(guān)信息。

中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所成功分離的我國第一株病毒毒種信息及其電鏡照片

毒種信息
毒種編號：CHPC 2020.00001; NPRC 2020.00001
中文名稱：新型冠狀病毒武漢株01
英文名稱：C-Tan-nCov Wuhan strain 01
分類學：2019-nCoV, 冠狀病毒β屬
分離來源：臨床患者
采集地：中國湖北武漢
分離時間：2020年1月6日
生物危害程度：二類
聯(lián)系郵箱：ivdcolm@ivdc.chinacdc.cn; chpc@chinacdc.cn
照片來源：國家病原微生物資源庫、(中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所)


新型冠狀病毒核酸檢測引物和探針序列（Specific primers and probes for detection 2019 novel coronavirus）

1.新型冠狀病毒核酸測定（實時熒光RT-PCR方法）
推薦選用針對新型冠狀病毒的開放讀碼框1ab（open reading frame,ORF1ab）、核殼蛋白（nucleoprotein，N）基因區(qū)域的引物和探針。

Target 1（ORF1ab）:
正向引物（F）：CCCTGTGGGTTTTACACTTAA
反向引物（R）：ACGATTGTGCATCAGCTGA
熒光探針（P）：5'-FAM-CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG-BHQ1-3'

Target 2（N）:
正向引物（F）：GGGGAACTTCTCCTGCTAGAAT
反向引物（R）：CAGACATTTTGCTCTCAAGCTG
熒光探針（P）：5'-FAM-TTGCTGCTGCTTGACAGATT-TAMRA-3'
可以核酸提取和實時熒光RT-PCR反應(yīng)體系參考相關(guān)廠家試劑盒說明。

2.結(jié)果判斷
陰性:無Ct值或Ct為40。
陽性：Ct值<37，可報告為陽性。
可疑：Ct值在37-40之間，建議重復實驗，若重做結(jié)果Ct值<40，擴增曲線有明顯起峰，該樣本判斷為陽性,否則為陰性。

信息來源：“新型冠狀病毒國家科技資源服務(wù)系統(tǒng)”官網(wǎng)http://nmdc.cn/#/nCoV

新型冠狀病毒國家科技資源服務(wù)系統(tǒng)（以下簡稱系統(tǒng)）由國家微生物科學數(shù)據(jù)中心和國家病原微生物資源庫聯(lián)合建設(shè)，由中國疾病預(yù)防控制中心、中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所、中國科學院微生物研究所、中國科學院病原微生物與免疫學重點實驗、中國疾病預(yù)防控制中心-中國科學院微生物研究所病原微生物資源與大數(shù)據(jù)聯(lián)合研究中心等單位共同建設(shè)。系統(tǒng)具備毒種信息、引物信息、全球冠狀病毒序列信息查詢及分析等功能。系統(tǒng)獲得國家科技資源共享服務(wù)平臺、艾滋病和病毒性肝炎等重大傳染病防治專項（2018ZX10734404、2018ZX1010100404）、中國科學院地球大數(shù)據(jù)先導A類專項（XDA19050301）、中國科學院戰(zhàn)略生物資源計劃（KFJ-BRP）等項目支持。

新冠病毒高清晶體結(jié)構(gòu)
2020年1月26日上�？萍即髮W免疫化學研究所和中國科學院上海藥物研究所抗2019－nCoV冠狀病毒感染聯(lián)合應(yīng)急攻關(guān)團隊宣布：上海科技大學饒子和／楊海濤課題組已測定新型冠狀病毒3CL水解酶（Mpro）高分率晶體結(jié)構(gòu)，以便有更多的科技工作者、特別是藥物研發(fā)的科技人員使用。

△2019－nCoV Mpro晶體結(jié)構(gòu)

據(jù)介紹，晶體結(jié)構(gòu)的坐標可到PDB蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫（Protein Data Bank， PDB）下載（PDB ID： 6LU7）。目前蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)坐標已投遞，系統(tǒng)正在處理中。如有急需，可以聯(lián)系上科大免疫化學研究所副研究員楊秀娜：yangxn＠shanghaitech.edu.cn。

新型冠狀病毒與人ACE2分子復合S蛋白的結(jié)構(gòu)模型
1月21日《中國科學：生命科學》雜志發(fā)表論文《Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission》，中國科學院上海巴斯德研究所、軍事醫(yī)學研究院國家應(yīng)急防控藥物工程技術(shù)研究中心/中科院分子植物卓越中心合成生物學重點實驗室聯(lián)合發(fā)現(xiàn)分離到的6個武漢新型冠狀病毒（SARI）序列幾乎完全一致，屬于Beta冠狀病毒屬（Betacoronavirus），分類上鄰近但不屬于SARS病毒，二者相似性約為70%；與“中東呼吸綜合征”MERS病毒相似性則只有40%。
SARS和MERS病毒的單股正鏈RNA基因組由包膜包裹，都有刺突蛋白（S蛋白），分別通過與血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2（ACE2）蛋白或DPP4蛋白結(jié)合，來感染人的呼吸道上皮細胞。


△新型冠狀病毒與人ACE2分子復合S蛋白的結(jié)構(gòu)模型


我們3D打印行業(yè)的有關(guān)技術(shù)人士，能否根據(jù)已公布的信息，對新型冠狀病毒不同維度（3D模型、晶體結(jié)構(gòu)、基因結(jié)構(gòu)等）進行3D建模呢？然后3D打印出來，供給相關(guān)工作人員使用？

對于內(nèi)部交叉復雜結(jié)構(gòu)的呈現(xiàn)，只要設(shè)計好3D模型，就可以使用透明/半透明/全彩色的3D打印技術(shù)進行打印出來。


△科學家們使用專業(yè)軟件建立的冠狀病毒類的模型，很多冠狀病毒長得比較相似。真正的2019－nCoV冠狀病毒尚未真正公布。

某醫(yī)學博士告訴南極熊，“可以打印出來試試，很多東西都是做出來后，大家一起討論讓它更完善的。把病毒具體化，可能對交流和研究，會有不同的思維火花出現(xiàn)。”

請愿意提供幫助/或需要幫助的科學家、醫(yī)生、3D建模、3D打印等專業(yè)人士，一起來嘗試做這個事情。請對此感興趣的專業(yè)人士加入下面微信群（非專業(yè)人士不要加）
如果已經(jīng)不能掃碼加入，可先加南極熊客服微信（nanjixiong3），備注留言“3D打印新冠狀病毒”。